Никак не могу удержать в голове эти команды, так как они нужные не так часто, но всё же настолько, чтобы записать и больше не искать.

Сколько места на диске:

df -h

Сколько места занимает папка:

du -sh ./folder

Что именно занимает больше всего места внутри папки:

du -sh ./folder/*

Команда:

sudo lsof -nP -i:$PORT | grep LISTEN

где $PORT — искомый порт.

Важно запускать с sudo, так как иначе можно пропустить процесс, запушенный из-под рута.